Archeologijos ekspozicija
Nauja archeologijos ekspozicija įrengta 2004 metais suremontuotame administracinio pastato rūsyje. Joje eksponuojami radiniai iš Utenos, Anykščių ir Molėtų rajonų. Ekspoziciją papildo trumpi tekstai apie atskirus laikotarpius, drabužių rekonstrukciniai piešiniai, baltų genčių žemėlapiai. Yra ir rajono archeologijos paminklų žemėlapis. Seniausi radiniai datuojami III tūkstantmečio prieš Kristų pabaiga, o naujausi - XIX a. pabaiga.
Akmens amžiaus vitrinoje daugiausia akmeninių ir titnaginių kirvukų. Ankstyvųjų metalų laikotarpio vitrinoje rodomi retų formų akmeniniai kirvukai, daug kaulo - rago dirbinių, kurie rasti kasinėjant Norkūnų piliakalnį. Šie eksponatai pasiskolinti iš Lietuvos nacionalinio muziejaus.
Geležies amžiaus vitrinose rodomi III - XIII a. papuošalai, darbo ir buities įrankiai, ginklai iš įvairių pilkapynų bei gyvenviečių. Rodoma ir to laikotarpio keramika. Atskiroje vitrinoje rodomi kovų su kryžiuočiais laikotarpio ginklai ir raitelio daiktai iš Černaučyznos (Anykščių r.) alkavietės ir Narkūnų piliakalnio. Septynios vitrinos skirtos viduramžių - naujųjų laikų senkapių radiniams. Rodomi to laikotarpio ginklai, darbo įrankiai, buities reikmenys, papuošalai, monetos. Papildomos informacijos suteikia šermenų pėdsakai - žiestų puodų šukės. Atskiroje vitrinoje eksponuojamas rekonstruotas XIV a. pabaigos kapas iš Pušaloto (Molėtų r.) senkapio.
Trys vitrinos skirtos XV a. antrosios pusės - XIX a. pabaigos puodų ir koklių šukėms, o viena - XVII a. - XVIII a. pradžios lobiams Ant pakylų eksponuojamos trinamosios girnos ir dubenuoti akmenys.
Etnografijos ir senosios skulptūros ekspozicija
2002 metais muziejaus pirmame aukšte buvo įrengta nauja etnografijos ir senosios skulptūros ekspozicija. Pirmojoje jos salėje vienoje pusėje įrengta aukštaitiška "stancija", o kitoje - gryčia su krosnimi ir įvairiais buities daiktais. Vitrinose rodomos apšvietimo, skalbimo ir lyginimo priemonės, lovatiesės, rankšluostinės ir rankšluosčiai.
Antrojoje salėje daug vietos skirta linų apdirbimo, bei verpimo priemonėms. Taip pat eksponuojami pieno ir grūdų laikymo bei perdirbimo ir duonos kepimo reikmenys. Rodomi ir ornamentuoti lankai, važelio lentos, žvaguliai, vadelės bei ganymo reikmenys: medinis kerdžiaus trimitas, dūdos ir dūdelės, botagas.
Amatų ir verslų ekspozicija
2006 metais ekspozicijos rūsyje buvo įrengta nauja amatų ir verslų ekspozicija. Dalis jos supažindina su XIX a. pabaigos - XX a. pradžios žemės dirbimo, sėjimo, derliaus nuėmimo ir kūlimo įrankiais. Ekspoziciją pagyvina nuotraukos vaizduojančios arimą su arklu jaučiais, arkliu, sėjimą, rugių kirtimą, kūlimą kultuvais.
Kita ekspozicijos dalis skirta kalvystei. Čia stovi žaizdras su dumplėmis, priekalas, prie sienos pritvirtinta bormašinė geležiai gręžti. Šalia daug kalvio naudotų įrankių ir jo nukaltų buities daiktų, geležiniai kryžiai. Nuotraukose matome kalvius ir į kalvę atvykusius vyrus darbo metu.
Antrame muziejaus aukšte numatyta istorinė ekspozicija dar neįrengta.
Ekspozicijos salėje buvo surengtos parodos:
1. Bažnytinio meno paroda (Iš Utenos rajono bažnyčių).
2. Primiršti daiktai (Iš Utenos kraštotyros muziejaus rinkinių).
3. Utenos miesto ir krašto istorija (iš Lietuvos valstybės istorijos archyvo, Lietuvos centrinio valstybės archyvo, Lietuvos literatūros ir meno archyvo, Kauno apskrities archyvo bei Utenos kraštotyros muziejaus rinkinių).
